온종합병원 건강검진센터는 2013년 3월 서면 정근안과병원빌딩 5, 6층에 1000평 규모로 오픈한 영남권 최초의 독립 건강검진 전문센터이다. 최신 시설과 첨단 장비를 갖추고 우수한 검진결과를 가장 빠르게 수검자에게 전달하는 원스톱 건강검진시스템을 구축하여 큰 호응을 얻고 있다. 아울러 놓치기 쉬운 안과 질환을 같은 건물에 있는 정근안과병원과 협력해 추가 정밀 검진을 실시하고 있다. 온종합병원 건강검진서면센터에서는 종합검진을 비롯해 국가에서 진행하고 있는 무료건강검진, 암검진, 생애전환기 건강검진, 학생건강검진 등과 직업환경의학과의 근로자 특수검진, 출장검진 등이 이루어진다. 또한 서면 메디컬스트리트 한복판에 위치하고 있는 접근성을 살려 외국인 건강검진 고객의 만족도 역시 높다. 서울대병원 강남센터와 연세대 세브란스병원 강북센터와 더불어 대한민국 명품 검진전문센터로 발돋움하고 있다.